Z enim odmevnejših imenovanj na začetku pontifikata je papež Leon XIV. za velikega kanclerja Papeškega teološkega inštituta Janeza Pavla II. za znanosti o zakonu in družini določil generalnega vikarja rimske škofije, kardinala Baldassareja Reina (na fotografiji spodaj). S tem z vrha inštituta odhaja nadškof Vincenzo Paglia, ki se pri 80 letih upokojuje. Potem ko je Paglia leta 2019 prevzel inštitut, je uvedel kontroverzne spremembe, nov statut leta 2019, zamenjal je številne profesorje in drugo osebje, v kurikulu pa je večji poudarek na »novi pastoralni teologiji«, na sociologiji in antropologiji ter manjši na moralni teologiji, s čimer se je inštitut oddaljil od prvotnega poslanstva, študija teologije telesa Janeza Pavla II. Paglia zaenkrat še ostaja vodja Papeške akademije za življenje.